Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Atg4dQ8BGV9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Atg4dQ8BGV9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Atg4dQ8BGV9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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