Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Atg4bQ8BGE6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Atg4bQ8BGE6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Atg4bQ8BGE6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Atg4bQ8BGE6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Atg4bQ8BGE6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4bQ8BGE6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Atg4bQ8BGE6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4bQ8BGE6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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