Protein–RNA interactions for Protein: Q810Q5

Nmes1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmes1Q810Q5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nmes1Q810Q5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nmes1Q810Q5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nmes1Q810Q5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nmes1Q810Q5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nmes1Q810Q5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmes1Q810Q5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms