Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NanogQ80Z64 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NanogQ80Z64 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NanogQ80Z64 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NanogQ80Z64 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NanogQ80Z64 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NanogQ80Z64 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NanogQ80Z64 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NanogQ80Z64 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NanogQ80Z64 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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