Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2bQ80XK6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms