Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nrde2Q80XC6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms