Protein–RNA interactions for Protein: Q80X53

Ccdc116, Coiled-coil domain-containing protein 116, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc116Q80X53 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ccdc116Q80X53 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc116Q80X53 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ccdc116Q80X53 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ccdc116Q80X53 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc116Q80X53 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc116Q80X53 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ccdc116Q80X53 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ccdc116Q80X53 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc116Q80X53 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc116Q80X53 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc116Q80X53 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc116Q80X53 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc116Q80X53 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc116Q80X53 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc116Q80X53 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc116Q80X53 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc116Q80X53 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc116Q80X53 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc116Q80X53 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc116Q80X53 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc116Q80X53 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ccdc116Q80X53 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc116Q80X53 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc116Q80X53 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ccdc116Q80X53 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc116Q80X53 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc116Q80X53 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc116Q80X53 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ccdc116Q80X53 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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