Protein–RNA interactions for Protein: Q80W99

Catsper3, Cation channel sperm-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper3Q80W99 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsper3Q80W99 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Catsper3Q80W99 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms