Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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