Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rims3Q80U57 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms