Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42bpbQ7TT50 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms