Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms