Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim46Q7TNM2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim46Q7TNM2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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