Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Zfp397Q7TNK4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms