Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms