Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shq1Q7TMX5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shq1Q7TMX5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms