Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SynmQ70IV5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms