Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms