Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms