Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms