Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

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Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dtx4Q6PDK8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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