Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms