Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac10Q6P3E7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac10Q6P3E7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac10Q6P3E7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac10Q6P3E7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac10Q6P3E7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac10Q6P3E7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac10Q6P3E7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac10Q6P3E7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac10Q6P3E7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac10Q6P3E7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac10Q6P3E7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac10Q6P3E7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac10Q6P3E7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac10Q6P3E7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac10Q6P3E7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms