Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms