Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms