Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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Soga3Q6NZL0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Soga3Q6NZL0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Soga3Q6NZL0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Soga3Q6NZL0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Soga3Q6NZL0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Soga3Q6NZL0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Soga3Q6NZL0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Soga3Q6NZL0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Soga3Q6NZL0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Soga3Q6NZL0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Soga3Q6NZL0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Soga3Q6NZL0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Soga3Q6NZL0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Soga3Q6NZL0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Soga3Q6NZL0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Soga3Q6NZL0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Soga3Q6NZL0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms