Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms