Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms