Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms