Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc66Q6NS45 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms