Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms