Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt77Q6IFZ6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms