Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil1Q6EDY6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Carmil1Q6EDY6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Carmil1Q6EDY6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Carmil1Q6EDY6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Carmil1Q6EDY6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Carmil1Q6EDY6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Carmil1Q6EDY6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Carmil1Q6EDY6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Carmil1Q6EDY6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Carmil1Q6EDY6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Carmil1Q6EDY6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms