Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms