Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lemd2Q6DVA0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lemd2Q6DVA0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms