Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms