Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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