Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms