Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc8eQ66JT1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms