Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms