Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VclQ64727 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
VclQ64727 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VclQ64727 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VclQ64727 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms