Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms