Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

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Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Defa17Q64016 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa17Q64016 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa17Q64016 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa17Q64016 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa17Q64016 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa17Q64016 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa17Q64016 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Defa17Q64016 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa17Q64016 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa17Q64016 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa17Q64016 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa17Q64016 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa17Q64016 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Defa17Q64016 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Defa17Q64016 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Defa17Q64016 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Defa17Q64016 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Defa17Q64016 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Defa17Q64016 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Defa17Q64016 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Defa17Q64016 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Defa17Q64016 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa17Q64016 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms