Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

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Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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AtmQ62388 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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AtmQ62388 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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AtmQ62388 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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AtmQ62388 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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AtmQ62388 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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AtmQ62388 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtmQ62388 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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AtmQ62388 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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AtmQ62388 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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AtmQ62388 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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AtmQ62388 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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