Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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