Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SypQ62277 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SypQ62277 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SypQ62277 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SypQ62277 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SypQ62277 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SypQ62277 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SypQ62277 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SypQ62277 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SypQ62277 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SypQ62277 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SypQ62277 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SypQ62277 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SypQ62277 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SypQ62277 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SypQ62277 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SypQ62277 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SypQ62277 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SypQ62277 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SypQ62277 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SypQ62277 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SypQ62277 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SypQ62277 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SypQ62277 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SypQ62277 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SypQ62277 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms