Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall3Q62255 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms