Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Six3Q62233 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Six3Q62233 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six3Q62233 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Six3Q62233 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Six3Q62233 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six3Q62233 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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