Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssr4Q62186 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms