Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3bQ62141 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms